一、提高绵羊产羔率的试验(论文文献综述)
周明亮,庞倩,陈明华,李燕,杨平贵[1](2021)在《我国绵羊FecB基因的研究进展》文中提出绵羊FecB基因是BMPR-IB基因的A746G位置的突变,导致249位置处的谷氨酰胺转变为精氨酸,从而引起一系列的生理效应。本文阐述了FecB基因的由来、定位、生理效应、国内绵羊群体的FecB基因的研究进展及FecB基因在国内的应用,以期促进我国绵羊多胎繁殖基因的导入,提高绵羊群体的繁殖能力。
陈维稷[2](2021)在《通过调整卵泡募集改善绵羊同期发情效果的研究》文中提出同期发情技术是进行绵羊批次化生产的关键,现有同期发情方案需要通过发情鉴定确定输精时间。本研究通过诱导卵泡募集,提高卵泡发育一致性与排卵集中度,为定时输精提供了条件。期望在保证妊娠率的同时避免发情鉴定,从而减少配种环节工作量,提高养殖效益。本试验将120只杜寒杂交羊随机等分为6组,进行了同期发情处理,每间隔12 h用B超测量其卵泡直径,直至排卵完成,根据排卵时间分布制定定时输精方案,进而扩大样本数量,验证方案可靠性。结果如下:1.对12 d孕酮栓组母羊进行了为期12天孕酮栓埋植处理,测量其排卵卵泡波各阶段持续时间。结果表明,12 d孕酮栓组母羊排卵卵泡波募集期、选择期和优势化期持续时间分别为2.68±0.93 d、0.90±0.34 d和0.75±0.25 d,募集期较选择期和优势化期持续时间差异显着(P<0.05)。2.以12 d孕酮栓组母羊排卵卵泡波各阶段持续时间为依据,将PMSG的注射时间由撤栓时提前到撤栓前2天。12 d 300 IU PMSG组和10 d 300 IU PMSG组在撤栓时卵泡发育至直径≥3.5 mm的母羊比例分别为25%和85%,差异显着(P<0.05),因此撤栓前2天注射PMSG有利于提高排卵卵泡发育一致性。3.为获得更高的排卵集中度,在放置孕酮栓的第10天利用不同剂量PMSG诱导卵泡募集,撤栓次日结合h CG处理,测量其排卵时间分布。结果表明,200 IU PMSG组、300 IU PMSG组和400 IU PMSG组排卵时间依次分布在撤栓后36~72 h、36~72 h和36~84 h。排卵率峰值均出现在撤栓后48~60 h,排卵率峰值分别为80%、65%和50%。4.以排卵时间分布为依据,制定不同定时输精方案。对271只杜寒杂交羊进行了定时输精处理,其中,200 IU PMSG组在撤栓后36 h和48 h、48 h和60 h实施两次子宫颈输精,妊娠率分别为54.05%和76.34%,差异显着(P<0.05)。综上所述,对杜寒杂交羊进行为期12天的孕酮栓埋植处理,在撤栓前2天注射200 IU PMSG诱导卵泡募集,撤栓次日注射500 IU h CG诱导排卵的同期发情方案具有较高的排卵集中度,配合撤栓后48 h和60 h两次子宫颈输精可获得较高的妊娠率。
张也[3](2021)在《干旱地区杜泊羊与湖羊杂交后代生产性能及多胎性研究》文中研究表明
肖帆[4](2021)在《绵羊mtDNA遗传多样性及其与胎产羔数相关性研究》文中提出线粒体DNA(mitochondrionDNA,mtDNA)是动物体内唯一存在的核外遗传物质,在不同品种和个体间存在广泛的多态性,其遗传效应对重要经济性状的作用不可忽视。胎产羔数(以下简称产羔数)是绵羊重要的经济性状,此性状在核基因上的研究非常多,但在mtDNA上的研究较少。本研究以小尾寒羊、湖羊、蒙古羊、欧拉羊和甘肃高山细毛羊为研究对象,通过PCR和DNA测序法对mtDNA遗传多样性及其与产羔性状的相关性进行分析,以期寻找影响绵羊产羔数的核外遗传分子标记,为品种选育及遗传资源的合理开发利用提供理论依据。主要研究结果如下:(1)在5个品种绵羊群体的D-loop区中GC含量低于AT含量,检测到256个多态位点、242个单倍型,D-loop高变区在mtDNA 15925~16074位点。在5个绵羊种群中,小尾寒羊和湖羊亲缘关系最近,甘肃高山细毛羊和蒙古羊亲缘关系最近,欧拉羊与小尾寒羊、湖羊亲缘关系最远。各品种试验绵羊mtDNA D-loop区均具有丰富的遗传多样性。(2)在D-loop区T15668C位点,产双羔的蒙古羊母羊与产单羔的蒙古羊母羊之间基因型分布差异显着(P<0.05),同时此位点也对蒙古羊产羔数有显着影响(P<0.05)。在T15445C、T15627C、T15657C、T15732C、G15977A和C16429T位点,产双羔的欧拉羊母羊与产单羔的欧拉羊母羊之间基因型分布差异均显着(P<0.05),同时上述6个位点对欧拉羊产羔数也有显着影响(P<0.05)。A15923G位点,产双羔的甘肃高山细毛羊母羊与产单羔的甘肃高山细毛羊母羊之间基因型分布差异显着(P<0.05),同时此位点也对甘肃高山细毛羊产羔数有显着影响(P<0.05)。(3)对D-loop区与产羔数显着相关的突变位点单倍型(Hap1、Hap2、Hap3和Hap4)与产羔数的相关性进行分析,结果表示:欧拉羊的Hap2型母羊产羔数显着大于Hap1型和Hap4型母羊产羔数(P<0.05)。对mtDNA D-loop的高变区单倍型(Hap5、Hap6、Hap7、Hap8和Hap9)与产羔数的相关性进行分析,结果显示:蒙古羊的Hap7型母羊产羔数显着高于Hap5、Hap6和Hap9型母羊产羔数(P<0.05),欧拉羊的Hap8型母羊产羔数显着高于Hap7型母羊产羔数(P<0.05)。(4)16S rRNA基因中A1099T和T1112C位点单倍型AT对其RNA二级结构有一定影响。ND6基因中C13576T、T13837C和T13855C位点单倍型CTT对其mRNA二级结构有一定影响。以上5个突变位点对各品种试验绵羊的产羔数影响均不显着(P>0.05)。这5个突变位点主要形成7种单倍型,其中蒙古羊HB型(ACTCC)母羊产羔数显着大于HD型(ATTTC)和HG型(TCTTC)母羊产羔数(P<0.05)。综上所述,绵羊mtDNA的遗传变异对其产羔数存在着遗传效应。
冯东青[5](2021)在《萨福克羊繁殖性能及GDF9基因研究》文中进行了进一步梳理本研究在河北省石家庄市某牧业有限公司完成。测定并分析了黑、白萨福克母羊繁殖率、产羔间隔、产羔羊月份分布产羔情况,研究了不同采精频率对精液品质影响,及白萨福克羊多胎候选基因GDF9进行研究。旨在为当地萨福克羊的繁殖和多胎选育工作提供科学的依据,为当地萨福克羊的引入及推广示范提供参考依据。具体结果如下:1.白萨福克母羊的平均产羔数为1.66±0.58只,黑萨福克母羊的平均产羔数为1.52±0.53只,白萨福克母羊的妊娠期为147.25±7.55天,活羔率超过90%以上。黑萨福克母羊的妊娠期为151.66±17.05天。综上所述:白萨福克羊繁殖性能略高于黑萨福克羊。2.黑、白萨福克羊人工受胎的产羔率分别为160.58%、156.10%,平均受胎率85.58%和71.97%,认为白萨福克羊的人工受胎效果高于黑萨福克羊。3.从射精量、精子活力、精子密度方面分析,最佳的采精频率分别为1次/2天、1次/2天、1次/2天,但综合分析认为萨福克种公羊的最适合采精频率为1次/2天。4.在萨福克羊多胎候选基因GDF9编码区260bp处筛查到一个G→A的突变位点(G1突变,c.260G>A),该突变位点存在2种基因型:GG和GA,GG与GA基因型平均产羔数分别为1.75±0.4只和1.33±0.51只,二者呈显着性差异,推测GDF9基因G1突变对萨福克羊繁殖性能存在一定的调控作用。生物信息学分析显示,GDF9基因G1突变位点对蛋白质二级结构有一定影响,但对蛋白质三级结构不存在影响。
赵建清[6](2021)在《超长时间低温保存绵羊精液对精子遗传物质的影响》文中研究表明本研究基于绵羊精液稀释液的发展趋势与超长时间低温保存绵羊精液对精子遗传物质的影响,选取大豆卵磷脂稀释液(试验组1)、专利卵黄稀释液(试验组2)及葡-柠稀释液(对照组)对采集的新鲜绵羊精液进行超长时间低温保存,检测在不同时段精子DNA、RNA完整性以及应用效果,以期揭示绵羊精子遗传物质随保存时间变化情况及遗传物质变化对精子质量与辅助生殖结局的影响,为后续超长时间低温保存绵羊精液的生产应用及制定标准制定提供理论基础与试验依据。1.为了确定超长时间低温保存对绵羊精子DNA完整性的影响。本试验采用假阴道法采集新鲜绵羊精液,用三组稀释液进行低温保存,分别选取保存至第0 h、24 h、72 h、144 h、216 h和288 h的绵羊精液进行活率检测,采用TUNEL法及SCGE法进行DNA完整性测定。结果显示:三组稀释液低温保存绵羊精液,随着低温保存时间的延长,绵羊精子DNA损伤呈逐渐上升趋势,其中葡-柠稀释液从第24 h开始极显着高于大豆卵磷脂稀释液和专利卵黄稀释液(P<0.01);而大豆卵磷脂稀释液与专利卵黄稀释液在不同时间点差异不显着,且两种稀释液在保存精液至第216 h时,精子DNA损伤出现显着增加;且试验数据表明精子活率与精子DNA损伤率呈负相关,SCGE法与TUNEL法检测均可作为评价绵羊精子质量的有效方法。2.为了建立绵羊精子RNA有效提取方法并检测精子RNA完整性随超长时间低温保存的变化情况。采用试剂盒法对新鲜绵羊精液进行精子RNA的提取,反转录c DNA及精子RNA质量验证;对三组稀释液低温保存的绵羊精液,分别选取保存至0 h、24 h、72 h、144 h、216 h和288 h的绵羊精液精子进行RNA提取及RNA完整性检测。结果:建立的绵羊精子RNA提取方法,可稳定的提取绵羊精子RNA,所获得的RNA纯度高,质量好,无其他非精子细胞的污染,首次获得绵羊单个精子细胞RNA含量约为40.54 fg;三组稀释液低温保存绵羊精子后,葡-柠稀释液在0-24 h精子RNA完整性与其他两组稀释液无显着性差异,但72 h后就无法获得精子RNA;大豆卵磷脂稀释液与专利卵黄稀释液低温保存绵羊精液,单个精子RNA含量(36.2~45.7 fg)及RNA完整性随保存时间的延长而无下降趋势。3.为了验证绵羊精液超长时间低温保存后是否能够生产健康后代。试验采集新鲜绵羊精液分别用大豆卵磷脂稀释液和专利卵黄稀释液进行低温保存,在低温保存的不同时间点进行精子活率、顶体完整率、质膜完整性及顶体蛋白酶活性检测;并用经两种稀释液低温保存至216 h的绵羊精液及葡-柠稀释液稀释的鲜精对329只同期发情母羊进行人工授精,在授精后进行受胎率、产羔率、母羔率及公母羔初生重检测。结果显示:大豆卵磷脂稀释液与专利卵黄稀释液超长时间低温保存绵羊精液,其精子活率、顶体完整率、质膜完整性及顶体蛋白酶活性均呈逐渐下降趋势;而采用大豆卵磷脂稀释液与卵黄稀释液低温保存第216 h的精液人工授精的受胎率(72.4%vs 73.2%vs 78.5%)、产羔率(126%vs 125%vs 130%)、母羔率(47.88%vs 46.47%vs 51.22%)及公母羔平均初生重均与葡-柠稀释液稀释的鲜精输精无显着性差异。综上所述,大豆卵磷脂稀释液与专利卵黄稀释液超长时间低温保存绵羊精液,精子DNA完整性随保存时间的延长呈逐渐下降趋势,在第216 h出现极显着下降;精子RNA完整性在288h内并不随保存时间的延长而出现显着下降趋势;且绵羊精液超长时间低温保存后人工授精仍可达到良好的受胎效果及产生健康后代。本研究揭示了绵羊精子遗传物质随超长时间低温保存变化的情况及对后代的影响,并有助于超长时间低温保存绵羊精液的生产应用及制定标准。
孙燕勇[7](2021)在《整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联》文中指出血液中繁殖激素的动态变化对于评估家畜繁殖性能具有重要意义,血液转录组不仅用来鉴定多个物种的免疫相关调控因子,近年来在家畜生产管理中的应用也逐渐开展。为解析绵羊全血转录组的动态时序表达与繁殖激素调控的关联,本研究以巴美肉羊为研究对象,对血液转录组及其表达基因型进行深入挖掘,将有助于提升血液应用于家畜繁殖性能辅助管理的新认识。本研究获得的主要研究结果如下:1、对绵羊血液转录组的时序动态表达进行研究,检测3、4和5月的不同经产羔类型绵羊的血液转录组,对基因表达与可变剪接进行组间差异分析初探。结果不同经产羔类型之间共检测到1417个差异表达基因,3332个差异可变剪接基因,相比无羔组,单羔组与双羔组基因表达模式更接近。差异表达基因与差异可变剪接共同功能富集结果说明血液表征产羔类型与卵母细胞减数分裂、激素调节和免疫应答等相关。不同月份之间共鉴定到660个差异表达基因,3135个差异可变剪接基因,动态时序表达的基因在功能层面直接或者间接影响激素水平,由此推断绵羊血液时序表达基因可能与激素紧密相关。2、在研究一差异基因分析的基础上,扩大到237个样本,构建加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),并结合表达全基因组关联分析(expression genome-wide association study,e GWAS)重点研究促卵泡素(follicle-stimulaing hormone,FSH)、促黄体素(luteinizing hormone,LH)、生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)和骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)血清浓度与基因动态表达、变异的关联。结果产羔类型差异表达基因分布在红色和紫色基因模块中较多,且全局网络中红色和紫色基因模块与产羔数关联度较高。通过e GWAS发现模块的显着关联基因主要位于X染色体,包括COIL、NELFE和GCLM等,参与调控卵母细胞成熟、颗粒细胞毛细血管再生、季节性繁殖和免疫应答等。时序差异表达基因主要分布在黄色和蓝色基因模块中,且在全局网络中黄色、蓝色基因模块与激素关联度较高。e GWAS显着关联基因包括CASP9和SRP68基因等,功能富集到催产素信号通路,均影响激素调控过程。最后使用机器学习和先验的绵羊GWAS数据库的方法对样品分组与全局网络模块的功能进行验证补充,证明了小样本差异表达基因在大样本分析中的支持度与可行性。总之,通过表达基因组层面解析了绵羊繁殖激素的关联网络,为繁殖激素时序生理状态的基因表达与变异体之间提供互补信息。3、为进一步挖掘高繁绵羊血清LH/FSH比值调控的深层机制。发现不同LH/FSH比值的差异表达基因在50~150之间。这些基因影响核糖体、催乳激素信号通路、促性腺激素信号通路、卵巢类固醇生成、催产素信号通路和花生四烯酸代谢等与激素调控相关的通路。共鉴定了涉及黄色与蓝色基因模块的1 823个显着关联与1 433个e QTL-SNP,且不均一的分布在各染色体,e QTL-SNP共影响到690个基因。鉴定到26 445个ASE-SNP,影响了4 970个基因,均一分布在各染色体,可见LH/FSH比值与绵羊血液基因表达关联过程中受到广泛的顺式调控作用。结果共筛选出8个候选标记物:PCNX4、FAS、RPL36AL、JCHAIN、LOC101113346、IQSEC1、RPL21和RPL8,大多数的表达基因型特征显现出等位基因不平衡现象,且受到至少一个e QTL-SNP与两个ASE-SNP的影响。4、为了挖掘高繁绵羊GDF9和BMP15影响的深层机制。我们分别对不同GDF9和BMP15血清浓度下的转录组进行比较与关联研究。结果血清中BMP15和GDF9的浓度可能依赖于调节它们共享的差异表达基因RPL23A、LOC101110403、PAQR5、LOC114116858,LOC114114874和NAIP建立内分泌信号交换。其中RPL23A、PAQR5与NAIP直接或者间接地参与到卵母细胞发育和卵巢功能,证明了血液在识别激素影响下的主要基因及关联生物学过程方面的潜力。同时发现血液中广泛存在对GDF9、BMP15的ASE-SNP与e QTL-SNP的调控,共鉴定到502个ASE-SNP,包含58个同时与e QTL-SNP关联。共同调控GDF9与BMP15的e QTL-SNP与ASE-SNP表达的候选血液生物标志物JAK1,IL6R,ITGA4,GAA,PRKD3,CAMK2D,TAB2和IQGAP1的基因型存在明显的等位基因表达失衡现象。综上,本研究描绘了绵羊血液转录组与繁殖激素的网络全景,并对繁殖激素关联的调控元件进行深层探讨,证明了血液在识别激素影响下的主要基因及关联生物学过程方面的潜力,也为任何以血液为适合代理组织的复杂性状提供重要借鉴。
陶林[8](2021)在《全基因组筛选云上黑山羊产羔数候选基因》文中提出山羊是重要的反刍家畜,在世界农业经济中发挥着重要作用。山羊产羔数对种群发展和行业走向影响深远。云上黑山羊是以云岭黑山羊为母本、奴比山羊为父本杂交选育而成的我国第一个肉用黑山羊培育品种。产羔数性状在该品种的形成过程中受到了强烈的人工选择,但仍存在较大差异。本研究认为不同繁殖力的云上黑山羊基因组信息(SNP、ROH、CNV和单倍型)存在差异,推测多羔群体受正选择基因可能与产羔数性状相关。因此,本研究组建了云上黑山羊单羔组(MG,n=20)和多羔组(PG,n=20)群体,基于全基因组重测序数据,鉴定PG的正选择基因(PSG),利用ROH岛、CNV和SNP关联分析筛选产羔数候选基因,以期解析云上黑山羊产羔数的遗传机制。本研究也鉴定了黄体期和卵泡期不同繁殖力云上黑山羊卵巢的差异表达基因(DEG),结合绵羊高产的PSG和绵羊卵巢DEG,以期探索DNA、RNA和通路水平绵羊和山羊高繁殖力的趋同信号。主要结果如下:Fst和nSL方法各鉴定了350个和76个PSG,富集到的繁殖相关条目包括顶体反应、内分泌抵抗和繁殖过程的调节等。黄体期和卵泡期PG和MG的血清雌激素和孕酮水平差异均不显着(P>0.05)。大群关联分析表明,GJB2、GJB6、STAB2和HS3ST2的部分位点显着影响产羔数(P<0.05),可能是潜在的分子标记。云上黑山羊卵巢RNA-seq表明,卵母细胞减数分裂和成熟等过程相关基因在卵泡期差异表达。绵羊和山羊高繁殖力趋同分析表明:(1)基因组层面,PSG(CHST11和SDCCAG8)可能通过TGFβ通路影响产羔数;(2)转录组层面,DEG(IGF1、GPRIN3、LIPG、SLC7A11、CHST15、SERPINA14、RSAD2和PPIG)可能通过卵泡发育、母体免疫营养和妊娠识别等多过程影响繁殖结果;(3)通路层面,母体松弛素水平、免疫力和抗病性可能与繁殖能力有关。比较分析发现,PG的长ROH比例较MG高,两组的近交系数差异不显着(P>0.05)。关联分析鉴定了2个产羔数相关ROH岛,ROH岛局部关联分析进一步分别鉴定了2个(DIO3和PPP2R5C)和10个候选基因(RBMS2、ANKRD52、SLC39A5、ESYT1、ERBB3、RPS26、LOC106502106、LOC102180464、LOC102170121和LOC108636015)。云上黑山羊扩群分析发现,SLC39A5基因的g.56470212G>A位点与第2胎产羔数显着关联,PPP2R5C基因的g.66072169G>A与第4胎和第5胎产羔数显着关联。全基因组CNV分析发现,PG和MG的CNV分布模式相似。本研究筛选到44个群体特有CNVR,并注释到SLC33A1、HIBCH和NLRP12等基因。关联分析表明,10个CNVR统计显着(P<0.05),注释到8个基因(如ODF3L2、MADCAM1、TPGS1和CDC34等)。这些基因涉及免疫调节、胚胎发育和细胞周期等过程。此外,对第1胎全基因组关联分析中PRP1的g.1826842C>G位点扩群分析发现,其显着影响云上黑山羊头两胎产羔数(P<0.05)。本研究综合多种基因组方法筛选了云上黑山羊产羔数候选基因和位点,巩固了其品种培育成果;探索了绵羊和山羊多羔的趋同信号,为高繁殖力肉羊新品种培育提供了依据。
赵金[9](2021)在《BMP15通过BMPR1B调控陕北白绒山羊卵泡颗粒细胞功能的分子机制》文中研究说明陕北白绒山羊是利用辽宁绒山羊与陕北黑山羊杂交选育的绒肉兼用型优质绒山羊品种,具有产绒量高、绒质优、耐粗饲和抗逆性强等优点。众所周知,母羊产羔率等繁殖性状作为绒山羊的重要经济性状之一,直接影响了其生产效率和经济效益。因此,研究影响绒山羊母羊产羔率的生物学机制,对提高绒山羊的养殖收益具有重要实践价值,也在山羊繁殖性能调控机制等基础研究中具有重要理论意义。母羊的产羔率是由多基因调控的复杂过程,其中骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)基因作为影响山羊产羔性状的候选基因,在陕北白绒山羊卵泡发育过程中的表达规律,影响BMPR1B基因表达的调控因素,以及BMPR1B调控卵泡发育的生物学机制等方面尚不清楚。本研究以陕北白绒山羊卵巢、卵泡以及卵泡颗粒细胞为研究对象,克隆BMPR1B基因并做生物信息学分析和遗传学分析,应用免疫组织化学技术、实时荧光定量多聚核苷酸链式反应技术、蛋白质印迹技术、5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷掺入技术、酶联免疫吸附剂测定技术、流式细胞术等研究了BMPR1B基因在陕北白绒山羊卵泡发育过程中的表达规律和影响其表达的调控因素;再通过包装慢病毒过表达BMPR1B、sh RNA干扰BMPR1B表达等方法,从颗粒细胞层面揭示了骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)通过受体BMPR1B影响陕北白绒山羊颗粒细胞增殖、凋亡及类固醇激素合成、分泌的分子调控机制。获得的主要研究结果如下:1.克隆陕北白绒山羊BMPR1B基因并进行序列分析。以陕北白绒山羊卵巢总RNA反转录的c DNA为模板,克隆出BMPR1B基因CDS区,测序得到该基因全长1509 bp。蛋白跨膜区分析表明BMPR1B属于跨膜蛋白,包含TGFβ家族I型受体特有的丝氨酸/苏氨酸(Gly/Ser)激酶结构域。2.对BMPR1B基因在陕北白绒山羊生殖系统中的表达模式和特点进行分析。BMPR1B在陕北白绒山羊子宫、卵巢和输卵管中均有表达且存在差异,其中卵巢的相对表达量最高,其次是输卵管,在子宫中表达量最低。BMPR1B在各发育阶段的卵泡和黄体内均有表达,其丰度随着卵泡发育成熟逐渐升高,在黄体内略有下降但仍维持较高的表达水平。BMPR1B在卵泡颗粒细胞和卵母细胞内均有表达,在颗粒细胞中的表达显着高于卵母细胞。BMPR1B基因与产羔数密切相关,在多羔母羊卵巢组织中的表达量显着高于单羔母羊。3.从细胞水平分析了BMP15对BMPR1B的调控作用。通过向体外培养的陕北白绒山羊卵泡颗粒细胞添加外源BMP15,证实BMP15可调控其I型受体BMPR1B和II型受体BMPR2的表达,并通过抑制BMPR1B基因的负调控mi RNA,mi R-125b的表达来上调BMPR1B基因的表达水平。4.研究证明BMP15通过受体BMPR1B激活MAPK通路调控山羊卵泡颗粒细胞增殖和凋亡。BMP15通过BMPR1B使得下游MAPK信号通路中ERKs磷酸化水平升高,激活MAPK ERK信号通路,上调细胞周期蛋白Cyclin E和周期蛋白依赖性激酶CDK2的表达,增加处于细胞周期S期细胞的比例,促进卵泡颗粒细胞的增殖;上调抑凋亡基因Bcl2的表达并下调促凋亡基因Bax和凋亡关键基因Caspase-3的表达,阻断细胞的凋亡途径,抑制颗粒细胞凋亡。5.研究证明BMP15通过受体BMPR1B激活Smad通路调控山羊卵泡颗粒细胞类固醇激素合成及分泌。BMP15通过BMPR1B使得下游Smad信号通路中Smad1/5/8蛋白磷酸化水平和Smad4蛋白表达水平升高,激活Smad信号通路,上调FSHR的表达水平,进而诱导类固醇激素合成相关基因St AR、CYP11A1和CYP19A1的表达,促进卵泡颗粒细胞E2、P4的合成和分泌。综上所述,本研究通过研究体外培养的山羊颗粒细胞,构建了BMP15通过BMPR1B对颗粒细胞增殖、凋亡及类固醇激素分泌的调控网络,揭示了BMP15通过受体BMPR1B调控绒山羊卵泡发育及闭锁的分子机制,为深入研究提高山羊繁殖力提供了新的实验依据,为提高陕北白绒山羊的繁殖性能提供理论和技术指导。
种玉晴[10](2021)在《绵羊产羔数性状的分子遗传机理研究》文中提出绵羊产羔数是育种的重要性状,它是提高产能和效益的关键指标。产羔数是微效多基因控制的复合数量性状,传统育种方法难以对产羔数实现高效的定向选育提高。本研究采用全基因组—基因通路—单基因的研究路线,通过全基因组选择信号检测挖掘绵羊产羔数候选基因,旨在解析绵羊多羔性状形成的分子遗传机理。以期为绵羊产羔数的高效选育提供候选基因或遗传标记,有助于绵羊产羔数的精准选育提高,对于绵羊产业的高效发展具有重要意义。本研究从400只经产湖羊母羊群体中挑选平均产羔数两尾分布的各20只湖羊,划分为单羔和多羔两个试验群体,进行全基因组重测序,通过全基因组选择信号检测筛选产羔数候选基因。结合转录组测序和选择作用分析解析BMP-BMPR-Smad信号通路基因以及ZP3基因在湖羊母羊性腺轴组织中的转录水平以及在物种间和绵羊种内的选择作用。基于蒙古系绵羊群体迁移过程中有效群体规模的变化及BMPR1B基因的FecB突变年龄的计算对FecB突变位点的选择作用进行深入分析。本研究的主要结果如下:(1)通过对单羔和多羔湖羊群体进行全基因组选择信号检测,筛选出了包括BMP2、BMP5、BMPR1B和ZP3基因等47个绵羊产羔数候选基因;(2)BMP2、BMP5、BMP6、BMP7、BMPR1A、BMPR1B、Smad1、Smad4和Smad5这9个基因在物种间受到纯化选择作用,而在绵羊这一枝中却检测到了正选择信号;(3)BMPR1B基因的FecB突变发生的时间约为五千年前。在距今约1600和1000年前,蒙古系绵羊群体发生了两次有效群体规模的骤减。Meta分析和回归分析结果表明FecB突变型等位基因频率与产羔数和纬度显着相关(p<0.05)。该突变位点在物种间受到纯化选择作用,而在绵羊群体中受到正选择作用;(4)本研究在ZP3基因中筛选到了一个非同义突变位点(rs401271989),该位点的变异与湖羊的头胎产羔数显着相关(p<0.05)。本研究的主要结论如下:(1)绵羊的产羔数性状是由多基因控制的,本研究共统计识别出47个绵羊产羔数候选基因;(2)绵羊BMPR1B基因的FecB突变能显着影响产羔数,每个拷贝可增加0.4-0.5个产羔数。估算该突变发生在约五千年前,随着蒙古系绵羊群体从蒙古高原向长江流域迁徙,选择压力的松弛驱动FecB突变在群体中迅速扩散;(3)湖羊ZP3基因中的非同义突变位点(rs401271989)与头胎产羔数显着相关,可作为产羔数选育的分子标记。综上所述,BMPR1B和ZP3基因可作为绵羊产羔数性状的主效基因或候选基因用于基因选择或分子标记辅助选择,以提高多羔绵羊选种的准确性。
二、提高绵羊产羔率的试验(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、提高绵羊产羔率的试验(论文提纲范文)
(1)我国绵羊FecB基因的研究进展(论文提纲范文)
1 FecB基因的定位 |
2 FecB基因的生理效应 |
2.1 激素水平的影响 |
2.2 卵巢的影响 |
2.3 排卵和发情 |
2.4 胚胎和羔羊的影响 |
3 我国绵羊FecB基因的研究进展 |
3.1 小尾寒羊FecB基因的研究 |
3.2 湖羊FecB基因的研究 |
3.3 策勒黑羊FecB基因的研究 |
3.4 其他群体FecB基因的研究 |
4 FecB基因的应用 |
(2)通过调整卵泡募集改善绵羊同期发情效果的研究(论文提纲范文)
符号说明 |
中文摘要 |
Abstract |
1 前言 |
1.1 绵羊同期发情定时输精技术研究进展 |
1.1.1 同期发情概念与原理 |
1.1.2 绵羊同期发情技术应用 |
1.1.3 输精方式与定时输精 |
1.2 激素对绵羊发情周期的调节 |
1.2.1 促性腺激素释放激素 |
1.2.2 促卵泡素与促黄体素 |
1.2.3 孕酮 |
1.2.4 孕马血清促性腺激素 |
1.2.5 人绒毛膜促性腺激素 |
1.3 绵羊卵泡发育规律 |
1.3.1 卵泡波理论 |
1.3.2 募集期与选择期 |
1.3.3 优势化与排卵过程 |
1.3.4 卵泡闭锁 |
1.4 B超在畜牧生产中的应用 |
1.4.1 妊娠诊断 |
1.4.2 卵泡监测与繁殖障碍排查 |
1.5 试验目的与意义 |
2 材料与方法 |
2.1 试验时间与地点 |
2.2 试验材料 |
2.2.1 试验动物 |
2.2.2 饲养管理 |
2.2.3 试验试剂 |
2.2.4 试验器材 |
2.3 试验设计 |
2.4 试验操作流程 |
2.4.1 放置孕酮栓与撤栓 |
2.4.2 精液稀释与活力测定 |
2.4.3 输精 |
2.4.4 卵泡发育监测与早期妊娠诊断 |
2.5 数据采集 |
2.6 相关概念与判别标准 |
2.7 统计分析 |
3 结果与分析 |
3.1 对PMSG注射时间的确定 |
3.2 PMSG对排卵卵泡波发育的影响 |
3.3 不同组别排卵时间分布 |
3.3.1 12d孕酮栓组排卵时间分布 |
3.3.2 不同时间注射PMSG排卵时间分布 |
3.3.3 不同剂量PMSG结合h CG处理排卵时间分布 |
3.4 PMSG对卵泡发育的影响 |
3.5 PMSG注射时间对排卵直径与排卵数的影响 |
3.6 妊娠率与产羔数据分析 |
3.7 卵泡发育与早期妊娠诊断B超影像分析 |
4 讨论 |
4.1 排卵卵泡波募集与PMSG处理时间调整依据 |
4.2 撤栓前进行PMSG处理对排卵卵泡发育的影响 |
4.3 不同定时输精方案对妊娠率的影响 |
4.4 绵羊早期妊娠诊断的最适时间 |
5 结论 |
参考文献 |
致谢 |
(4)绵羊mtDNA遗传多样性及其与胎产羔数相关性研究(论文提纲范文)
摘要 |
SUMMARY |
第一章 文献综述 |
1 mtDNA概述 |
1.1 mtDNA结构 |
1.2 mtDNA遗传特点 |
1.2.1 母系遗传 |
1.2.2 独特的密码系统 |
1.2.3 突变率高,进化速率快 |
1.2.4 结构紧密,编码效率高 |
1.2.5 无组织特异性 |
1.2.6 异质性 |
1.2.7 具有阈值效应 |
1.3 mtDNA研究进展 |
1.3.1 mtDNA遗传多样性的研究进展 |
1.3.2 mtDNA与家畜经济性状的关系研究进展 |
1.3.3 mtDNA与疾病的关系研究进展 |
2 养羊业生产现状及绵羊品种简介 |
2.1 绵羊起源 |
2.2 养羊业生产现状 |
2.3 绵羊品种简介 |
3 遗传标记技术的发展 |
3.1 RFLP |
3.2 SSR |
3.3 SNP |
4 试验研究的目的及意义 |
第二章 绵羊D-loop区遗传多样性及其与产羔数的相关性研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 样品采集 |
1.1.2 试验仪器设备 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 提取血液基因组DNA |
1.2.2 血液基因组DNA检测 |
1.2.3 引物合成 |
1.2.4 PCR反应体系及反应程序 |
1.2.5 PCR扩增产物的检测及其测序 |
1.3 数据分析 |
2 结果与分析 |
2.1 血液基因组DNA提取结果 |
2.2 PCR扩增产物检测及其测序结果 |
2.3 不同品种绵羊 D-loop 区遗传多样性研究 |
2.3.1 5个品种绵羊D-loop区序列分析 |
2.3.2 5个品种绵羊D-loop区遗传多样性分析 |
2.3.3 5个品种绵羊的系统发育树和遗传距离 |
2.4 绵羊D-loop区变异与产羔数关联分析 |
2.4.1 不同产羔类型绵羊D-loop区变异位点分析 |
2.4.2 不同产羔类型绵羊D-loop区变异位点基因型分布差异分析 |
2.4.3 绵羊D-loop区变异位点与产羔数的相关性分析 |
2.4.4 绵羊D-loop区单倍型与产羔数的相关性分析 |
3 讨论 |
3.1 遗传多样性分析 |
3.2 D-loop区变异与产羔数相关性分析 |
4 小结 |
第三章 mtDNA16S rRNA和 ND6 基因变异与产羔数的相关性研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 样品采集 |
1.1.2 试验仪器设备 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 DNA的提取及检测 |
1.2.2 绵羊mtDNA16S rRNA和 ND6 基因引物合成 |
1.2.3 PCR反应体系及反应程序 |
1.2.4 PCR扩增产物的检测及其测序 |
1.2.5 RNA二级结构预测分析 |
1.3 数据分析及软件使用 |
2 结果与分析 |
2.1 血液基因组DNA提取结果 |
2.2 PCR扩增产物检测及其测序结果 |
2.2.1 16S rRNA基因PCR扩增产物检测及其测序结果 |
2.2.2 ND6 基因PCR扩增产物检测及其测序结果 |
2.3 绵羊mtDNA16S rRNA和 ND6 基因变异与产羔数关联分析 |
2.3.1 不同产羔类型绵羊16S rRNA和 ND6 基因变异位点分析 |
2.3.2 不同产羔类型绵羊16S rRNA和 ND6 基因变异位点基因型分布差异分析 |
2.3.3 16S rRNA和 ND6 基因变异位点与产羔数的相关性分析 |
2.4 16S rRNA和 ND6 基因变异位点单倍型对其RNA二级结构的影响 |
2.4.1 16S rRNA基因变异位点单倍型对其RNA二级结构的影响 |
2.4.2 ND6 基因变异位点单倍型对其RNA二级结构的影响 |
2.5 16S rRNA和 ND6 基因变异位点单倍型与产羔数的相关性分析 |
3 讨论 |
3.1 绵羊mtDNA16S rRNA和 ND6 基因变异与产羔数相关性分析 |
4 小结 |
第四章 结论 |
参考文献 |
附录 |
附表1 试验仪器及设备 |
附录1 紫外线分光光度计检测绵羊血液DNA |
附录2 琼脂糖凝胶电泳检测绵羊血液全基因组DNA |
附录3 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 |
致谢 |
作者简介 |
攻读硕士学位期间发表的论文 |
导师简介 |
(5)萨福克羊繁殖性能及GDF9基因研究(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
第一章 绪论 |
1.1 发展肉羊产业的重要性 |
1.2 国内外肉羊产业发展及生产现状 |
1.2.1 世界肉羊产业发展现状 |
1.2.2 我国肉羊产业发展现状 |
1.2.3 河北省肉羊产业发展现状 |
1.3 萨福克羊在我国的适应性及利用情况 |
1.4 绵羊GDF9 基因研究进展 |
1.5 研究目的、意义、内容 |
第二章 萨福克母羊繁殖性能分析 |
2.1 试验场地与环境 |
2.2 试验羊只及饲养管理 |
2.2.1 试验羊及繁殖性能指标的选取 |
2.2.2 试验羊只的饲养管理 |
2.3 数据统计与分析 |
2.4 结果与分析 |
2.4.1 黑、白萨福克肉羊产羔情况统计 |
2.4.2 萨福克羊妊娠期分析 |
2.5 讨论 |
2.5.1 萨福克羊产羔情况 |
2.5.2 萨福克母羊妊娠期分析 |
2.6 小结 |
第三章 人工授精-同期发情技术在萨福克母羊繁殖中应用效果 |
3.1 试验材料与方法 |
3.1.1 试验时间地点 |
3.1.2 试验羊只选取与饲养 |
3.2 试验方法 |
3.2.1 试验母羊的处理 |
3.2.2 公羊调教及精液品质检查 |
3.3 结果与分析 |
3.3.1 黑、白萨福克母羊受胎率比较 |
3.3.2 黑、白萨福克母羊产羔分析 |
3.4 讨论 |
3.5 小结 |
第四章 采精频率对白萨福克种公羊精液品质的影响 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验对象 |
4.1.2 试验材料与试剂 |
4.1.3 试验设计 |
4.1.4 精液样品的采集 |
4.1.5 精液品质分析 |
4.1.6 统计与分析 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 采精频率对精液量的影响 |
4.2.2 采精频率对精子密度的影响 |
4.2.3 采精频率对精子活力的影响 |
4.3 讨论 |
4.3.1 采精频率对精液量的影响 |
4.3.2 采精频率对精子密度的影响 |
4.3.3 采精频率对精子活力的影响 |
4.4 小结 |
第五章 白萨福克羊GDF9 基因多态性和生物信息学分析 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 试验材料 |
5.1.2 试验方法 |
5.2 结果与分析 |
5.2.1 基因组DNA提取结果 |
5.2.2 PCR扩增结果 |
5.2.3 GDF9 基因酶切测定结果 |
5.2.4 GDF9 基因G1 突变点多态性分析 |
5.2.5 GDF9 基因G1 突变点分析 |
5.2.6 GDF9 蛋白二级结构预测 |
5.2.7 GDF9 蛋白三级结构预测 |
5.2.8 GDF9 基因多态性与萨福克羊产羔数的相关性分析 |
5.3 讨论 |
第六章 全文总结 |
参考文献 |
致谢 |
(6)超长时间低温保存绵羊精液对精子遗传物质的影响(论文提纲范文)
摘要 |
abstract |
缩略词表 |
第1章 绪论 |
1.1 绵羊精液低温液态保存的研究现状 |
1.2 稀释液低温保护剂的研究进展 |
1.3 精子DNA损伤机制及检测的研究进展 |
1.3.1 TUNEL法检测原理及应用 |
1.3.2 SCGE法检测DNA损伤的机理及应用 |
1.4 精子RNA研究进展 |
1.5 精子品质的检测指标 |
1.5.1 精子活率 |
1.5.2 质膜完整性 |
1.5.3 顶体完整性 |
1.5.4 精子顶体蛋白酶活性 |
1.6 拟解决的关键技术问题及应用前景 |
1.7 技术路线 |
第2章 超长时间低温保存绵羊精液对精子DNA完整性变化的影响 |
2.1 材料与方法 |
2.1.1 试验材料 |
2.1.2 主要试剂与仪器 |
2.1.3 稀释液的制备与使用 |
2.1.4 TUNEL检测方法步骤 |
2.1.5 SCGE检测方法步骤 |
2.1.6 数据统计与分析 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 TUNEL法检测绵羊精子DNA损伤 |
2.2.2 SCGE法检测绵羊精子DNA损伤 |
2.2.3 TUNEL法与SCGE法对绵羊精子DNA损伤的检测 |
2.3 讨论 |
2.4 小结 |
第3章 超长时间低温保存绵羊精液对精子RNA完整性的影响 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 试验材料 |
3.1.2 主要试剂和仪器 |
3.1.3 方法 |
3.1.4 数据分析 |
3.2 结果 |
3.2.1 绵羊精子的纯化结果 |
3.2.2 精子总RNA纯度检测 |
3.2.3 基因组DNA去除效果检测 |
3.2.4 体细胞去除效果检测 |
3.2.5 三种稀释液低温保存精液不同时间段精子RNA含量检测 |
3.2.6 三种稀释液低温保存精液不同时间段精子RNA完整性检测 |
3.3 讨论 |
3.4 小结 |
第4章 超长时间低温保存绵羊精液的效果研究 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验材料 |
4.1.2 主要试剂与仪器 |
4.1.3 溶液的配制 |
4.1.4 稀释液的制备与储存 |
4.1.5 明胶膜片的制备 |
4.1.6 精液采集与保存 |
4.1.7 精子活率检测 |
4.1.8 精子顶体完整率检测 |
4.1.9 精子质膜完整性检测 |
4.1.10 精子顶体蛋白酶活性的测定 |
4.1.11 人工授精及受胎率检测 |
4.1.12 数据统计与分析 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 三种稀释液超长时间低温保存绵羊精液对精子活率的影响 |
4.2.2 两种稀释液超长时间低温保存绵羊精液对精子顶体完整率的影响 |
4.2.3 两种稀释液超长时间低温保存绵羊精液对精子质膜完整性的影响 |
4.2.4 两种稀释液超长时间低温保存绵羊精液对精子顶体蛋白酶活性的影响 |
4.2.5 三种稀释液人工授精后母羊产羔情况 |
4.3 讨论 |
4.4 小结 |
第5章 结论 |
参考文献 |
致谢 |
作者简介 |
(7)整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联(论文提纲范文)
摘要 |
abstract |
1 引言 |
1.1 血液转录组的应用研究 |
1.1.1 预测疾病生物标记物 |
1.1.2 鉴定免疫调控因子 |
1.1.3 家畜生产管理中的应用 |
1.2 绵羊繁殖转录组研究进展 |
1.2.1 巴美肉羊概况 |
1.2.2 基于性腺轴的研究进展 |
1.2.3 可变剪接与单核苷酸多态性的调控研究 |
1.3 绵羊产羔与排卵的调节机制 |
1.3.1 BMP15、GDF9 对排卵和产羔数的调节 |
1.3.2 FSH、LH对排卵和产羔数的调节 |
1.4 研究的主要内容 |
1.5 研究目的与意义 |
2 研究一不同产羔类型绵羊血液转录组时序动态表达初探 |
2.1 材料与方法 |
2.1.1 试验材料 |
2.1.2 试验主要仪器与试剂 |
2.1.3 RNA提取 |
2.1.4 转录组文库构建与测序 |
2.1.5 测序数据质量评估和过滤去噪 |
2.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
2.1.7 差异表达基因分析 |
2.1.8 差异可变剪接分析 |
2.1.9 差异表达基因与差异可变剪接的聚类分析 |
2.1.10 短时序表达分析 |
2.1.11 功能富集分析 |
2.1.12 统计显着性分析 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 绵羊产羔类型的差异表达基因分析 |
2.2.2 绵羊产羔类型差异可变剪接分析 |
2.2.3 绵羊产羔类型差异表达基因与差异可变剪接的聚类分析 |
2.2.4 绵羊转录组时序表达变化 |
2.2.5 绵羊转录组时序动态表达模块分析 |
2.2.6 绵羊转录组时序可变剪接变化 |
2.2.7 绵羊产羔类型与时序性表达的整合分析 |
2.2.8 试验重复性验证 |
2.3 讨论 |
2.4 结论 |
3 研究二大样本动态血液基因整合e GWAS解析绵羊繁殖激素共表达网络 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 试验材料 |
3.1.2 试验主要仪器与试剂 |
3.1.3 RNA 提取与建库测序 |
3.1.4 测度数据质量评估与过滤去噪 |
3.1.5 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
3.1.6 血清LH、FSH、GDF9与BMP15 的浓度测定 |
3.1.7 加权基因共表达网络分析 |
3.1.8 eGWAS分析 |
3.1.9 基因功能注释与候选位点的确定 |
3.1.10 构建主题文献摘要与全文的绵羊GWAS数据库 |
3.1.11 机器学习验证分析 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 全局样本构建繁殖激素调控的共表达网络 |
3.2.2 基于表达的全基因组关联研究 |
3.2.3 产羔类型相关的模块 |
3.2.4 激素调控相关模块 |
3.2.5 产羔类型与月份之间的关联模块 |
3.2.6 绵羊GWAS数据库验证全局网络的功能属性 |
3.2.7 机器学习验证小样本产羔类型差异表达基因对于大样本的支持度 |
3.3 讨论 |
3.4 结论 |
4 研究三 LH/FSH 血清浓度比值的绵羊等位基因特异性表达与遗传关联研究 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验样品 |
4.1.2 试验主要仪器与设备 |
4.1.3 RNA提取 |
4.1.4 转录组文库构建与测序 |
4.1.5 测序数据质量评估与过滤去噪 |
4.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
4.1.7 LH、FSH激素浓度的测定 |
4.1.8 差异表达基因分析 |
4.1.9 差异ASE分析 |
4.1.10 eQTL分析 |
4.1.11 功能富集分析 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 LH与FSH血清浓度相关性分析 |
4.2.2 LH/FSH比值在不同月份的方差分析 |
4.2.3 LH/FSH比值在不同月份的转录组差异分析 |
4.2.4 LH/FHS比值差异表达基因通路富集分析 |
4.2.5 ASE证实血液存在广泛的顺式调控影响 |
4.2.6 eQTL-SNP和 ASE-SNP联合分析 |
4.2.7 eQTL-SNP与 ASE-SNP富集分析 |
4.2.8 LH/FSH比值生物标志物的表达基因型 |
4.2.9 LH/FSH比值生物标志物的遗传调控网络 |
4.3 讨论 |
4.4 结论 |
5 研究四 GDF9、BMP15 血清浓度的绵羊等位基因特异性表达与遗传关联研究 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 试验样品 |
5.1.2 试验主要仪器与设备 |
5.1.3 RNA提取 |
5.1.4 转录组文库构建与测序 |
5.1.5 测序数据质量评估与过滤去噪 |
5.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
5.1.7 血清GDF9、BMP15 激素浓度的测定 |
5.1.8 差异表达基因分析 |
5.1.9 差异ASE分析 |
5.1.10 eQTL分析 |
5.1.11 功能富集分析 |
5.2 结果与分析 |
5.2.1 不同GDF9 血清浓度的差异表达基因分析 |
5.2.2 不同GDF9 血清浓度的ASE分析 |
5.2.3 不同BMP15 血清浓度的差异表达基因分析 |
5.2.4 不同BMP15 血清浓度的ASE分析 |
5.2.5 GDF9与BMP15 的联合分析 |
5.3 讨论 |
5.4 结论 |
6 全文主要结论、创新点及展望 |
6.1 论文主要结论 |
6.2 论文创新点 |
6.3 论文未来研究展望 |
致谢 |
参考文献 |
附录 |
作者简介 |
(8)全基因组筛选云上黑山羊产羔数候选基因(论文提纲范文)
摘要 |
abstract |
第一章 绪论 |
1.1 提高山羊产羔效率的繁殖和遗传途径 |
1.1.1 突破季节性繁殖 |
1.1.2 提高单胎产羔数 |
1.2 山羊全基因组研究 |
1.2.1 选择信号 |
1.2.2 GWAS |
1.2.3 ROH |
1.2.4 CNV |
1.3 趋同进化 |
1.4 本研究的目的与意义 |
1.5 技术路线 |
第二章 选择信号分析 |
2.1 材料与方法 |
2.1.1 试验动物、表型和样品收集 |
2.1.2 全基因组测序与SNP检测 |
2.1.3 群体结构分析 |
2.1.4 选择清除分析 |
2.1.5 大群验证 |
2.1.6 同期发情、激素测定与卵巢转录组 |
2.1.7 绵羊山羊高繁殖力的遗传趋同 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 基因组测序数据概要 |
2.2.2 群体遗传结构 |
2.2.3 选择清除分析 |
2.2.4 P_4 和E_2 测定 |
2.2.5 候选基因与山羊产羔数的关联分析 |
2.2.6 RNA-seq |
2.2.7 绵羊山羊高繁殖力的遗传趋同 |
2.3 讨论 |
2.3.1 山羊产羔数的选择信号 |
2.3.2 遗传趋同 |
2.4 小结 |
第三章 全基因组ROH分析 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 试验动物、表型和测序数据 |
3.1.2 ROH检测及近交评估 |
3.1.3 SLC39A5和PPP2R5C与产羔数的关联 |
3.2 结果与分析 |
3.3 讨论 |
3.4 小结 |
第四章 全基因组CNV分析 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验动物、表型和测序数据 |
4.1.2 CNV检测与关联分析 |
4.1.3 荧光定量PCR验证CNVR |
4.2 结果与分析 |
4.3 讨论 |
4.3.1 CNV分布模式 |
4.3.2 CNVR关联分析 |
4.4 小结 |
第五章 PRP1 基因多态性与产羔数的关联分析 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 试验动物、表型和基因型数据 |
5.1.2 GWAS |
5.1.3 PRP1 多态性与产羔数的关联分析 |
5.2 结果与分析 |
5.3 讨论 |
5.4 小结 |
第六章 结论 |
参考文献 |
附录 |
致谢 |
作者简历 |
(9)BMP15通过BMPR1B调控陕北白绒山羊卵泡颗粒细胞功能的分子机制(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
文献综述 |
第一章 哺乳动物的卵泡发育和卵泡闭锁 |
1.1 引言 |
1.2 哺乳动物的卵泡结构和卵泡发育 |
1.3 哺乳动物的卵泡闭锁 |
1.4 颗粒细胞在卵泡发育中的作用 |
1.4.1 颗粒细胞增殖在卵泡发育中的作用 |
1.4.2 颗粒细胞凋亡在卵泡发育中的作用 |
1.4.3 颗粒细胞分泌C型钠肽对卵母细胞的作用 |
第二章 BMPR1B基因研究进展 |
2.1 引言 |
2.2 BMPR1B基因的发现和定位 |
2.3 BMPR1B基因结构和蛋白结构 |
2.4 BMPR1B在绵羊和山羊各器官和组织中的表达 |
2.5 BMPR1B参与的信号通路 |
2.5.1 BMP15 |
2.5.2 TGFβ/Smad信号转导通路 |
2.6 BMPR1B基因的生物学功能 |
2.6.1 BMPR1B对繁殖性能的影响 |
2.6.2 BMPR1B对羊毛细度的调控作用 |
2.6.3 BMPR1B对骨骼发育及维持的作用 |
2.6.4 BMPR1B对肿瘤的影响 |
2.6.5 BMPR1B的其它生物学功能 |
2.7 本研究的目的意义 |
2.8 本研究的技术路线图 |
试验研究 |
第三章 陕北白绒山羊BMPR1B基因的序列特征与表达模式研究 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 试验材料 |
3.1.2 试验方法 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 山羊BMPR1B m RNA序列的克隆及多态性分析 |
3.2.2 山羊BMPR1B氨基酸序列特征分析 |
3.2.3 BMPR1B在不同产羔数绒山羊组织中的差异表达分析 |
3.2.4 BMPR1B在不同大小卵泡及卵母细胞和颗粒细胞中的表达分析 |
3.3 讨论 |
3.4 小结 |
第四章 BMP15 对绒山羊卵泡颗粒细胞生物学功能的调控作用 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验材料 |
4.1.2 试验方法 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 山羊卵泡颗粒细胞的分离培养 |
4.2.2 山羊卵泡颗粒细胞的鉴定 |
4.2.3 BMP15 对山羊卵泡颗粒细胞增殖的影响 |
4.2.4 BMP15 对山羊卵泡颗粒细胞凋亡的影响 |
4.2.5 BMP15 对山羊卵泡颗粒细胞类固醇激素合成的影响 |
4.3 讨论 |
4.4 小结 |
第五章 BMP15对绒山羊卵泡颗粒细胞BMPR1B及Smad通路和MAPK通路的调控作用 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 试验材料 |
5.1.2 试验方法 |
5.2 结果与分析 |
5.2.1 BMP15对BMPR2和BMPR1B表达的影响 |
5.2.2 BMP15对BMPR1B的表达调控 |
5.2.3 BMP15对Smad信号通路的影响 |
5.2.4 BMP15协同FSH对类固醇激素分泌的影响 |
5.2.5 BMP15对MAPK信号通路的影响 |
5.3 讨论 |
5.4 小结 |
第六章 BMP15通过BMPR1B对绒山羊卵泡颗粒细胞的调控作用研究 |
6.1 材料与方法 |
6.1.1 试验材料 |
6.1.2 试验方法 |
6.2 结果与分析 |
6.2.1 BMPR1B过表达载体的构建 |
6.2.2 BMPR1B干扰载体的构建和筛选 |
6.2.3 慢病毒包装纯化及滴度测定 |
6.2.4 卵泡颗粒细胞BMPR1B基因过表达及干扰效率检测 |
6.2.5 BMP15通过BMPR1B对卵泡颗粒细胞增殖的影响 |
6.2.6 BMP15通过BMPR1B对卵泡颗粒细胞凋亡的影响 |
6.2.7 BMP15通过BMPR1B对卵泡颗粒细胞类固醇激素合成的影响 |
6.2.8 BMP15通过BMPR1B对Smad信号通路和MAPK信号通路的影响 |
6.3 讨论 |
6.4 小结 |
第七章 总结论 |
7.1 结论 |
7.2 创新点 |
7.3 下一步需要研究的主要问题 |
参考文献 |
附录 |
附录一 主要试验仪器 |
附录二 主要试验试剂与耗材 |
附录三 试验操作步骤 |
缩略词表 |
致谢 |
作者简介 |
(10)绵羊产羔数性状的分子遗传机理研究(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
缩略词表 |
第一章 文献综述 |
1 研究问题的由来 |
2 绵羊产羔数性状的研究进展 |
2.1 绵羊的产羔数性状 |
2.2 绵羊产羔数性状主效基因的研究进展 |
2.2.1 BMPR1B基因 |
2.2.2 BMP15基因 |
2.2.3 GDF9基因 |
3 全基因组重测序和选择信号检测 |
3.1 高通量测序技术的发展 |
3.2 全基因组重测序技术的在畜牧领域的应用 |
3.3 全基因组选择信号检测 |
3.3.1 基于等位基因频率谱的方法 |
3.3.2 基于连锁不平衡的方法 |
3.3.3 基于群体分化的方法 |
3.3.4 各类选择信号检验方法的适用范围 |
4 本研究的目的和意义 |
第二章 绵羊产羔数候选基因的筛选 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 试验湖羊群体选择与产羔数资料记录收集 |
1.1.2 血液样本采集 |
1.1.3 本试验所用仪器设备 |
1.1.4 主要试剂 |
1.1.5 主要化学试剂的配置 |
1.1.6 本试验中所用主要分子生物学网站与软件 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 DNA提取与质量检测 |
1.2.2 DNA文库构建与测序 |
1.2.3 全基因组遗传变异分析 |
1.2.4 全基因组选择信号检验 |
2 结果 |
2.1 单羔和多羔组湖羊群体产羔数分布情况 |
2.2 湖羊全基因组测序结果 |
2.2.1 DNA样品质量与浓度 |
2.2.2 重测序数据质量统计 |
2.3 全基因组选择信号检测结果 |
2.3.1 全基因组选择信号扫描 |
2.3.2 通路富集 |
2.3.3 正选择基因鉴定 |
3 讨论 |
3.1 全基因组选择信号检测策略 |
3.2 多羔候选基因的筛选 |
4 小结 |
第三章 BMP-BMPR-Smad通路基因在湖羊下丘脑、垂体和卵巢中的转录水平研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 试验羊选择 |
1.1.2 组织样本采集 |
1.1.3 本试验所用仪器设备 |
1.1.4 主要试剂 |
1.1.5 本试验中所用主要分子生物学网站与软件 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 总RNA的提取及质量检测 |
1.2.2 cDNA的合成及质量检测 |
1.2.3 转录组测序与数据处理 |
2 结果 |
2.1 湖羊BMP家族基因在下丘脑-垂体-卵巢中转录水平的变化 |
2.2 湖羊BMPR家族基因在下丘脑-垂体-卵巢中转录水平的变化 |
2.3 湖羊Smad家族基因在下丘脑-垂体-卵巢中转录水平的变化 |
3 讨论 |
4 小结 |
第四章 绵羊BMP-BMPR-Smad通路基因选择作用研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 40个物种的BMP-BMPR-Smad通路基因的编码区序列 |
1.1.2 蒙古系绵羊重测序数据 |
1.1.3 本试验中所用主要分子生物学网站与软件 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 物种间BMP-BMPR-Smad通路基因选择信号检测 |
1.2.2 绵羊群体间BMP-BMPR-Smad通路基因选择信号检测 |
2 结果 |
2.1 BMP-BMPR-Smad通路基因在物种间的选择信号 |
2.2 BMP-BMPR-Smad通路基因在蒙古羊群体间的选择信号 |
3 讨论 |
4 小结 |
第五章 绵羊BMPR1B基因FecB突变对产羔数的遗传效应及其选择作用研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 试验绵羊群体选择与产羔数资料记录收集 |
1.1.2 本试验所用仪器设备 |
1.1.3 主要试剂 |
1.1.4 主要化学试剂的配置 |
1.1.5 本试验中所用主要分子生物学网站与软件 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 BMPR1B基因正选择位点注释及连锁不平衡检验 |
1.2.2 BMPR1B基因Fec B突变位点及其相邻微卫星位点多态性检测 |
1.2.3 Fec B突变对绵羊产羔数效应的Meta分析 |
1.2.4 Fec B突变年龄估算 |
1.2.5 蒙古系绵羊有效群体含量估计 |
1.2.6 蛋白质理化性质和三维结构预测 |
2 结果 |
2.1 BMPR1B基因正选择位点鉴定 |
2.2 FecB突变位点在蒙古系绵羊群体中的分布 |
2.3 FecB突变位点对绵羊产羔数的遗传效应 |
2.3.1 纳入文献统计 |
2.3.2 异质性检验结果 |
2.3.3 发表偏倚检验结果 |
2.3.4 FecB突变位点对绵羊产羔数的遗传效应统计 |
2.4 FecB突变对BMPR1B蛋白理化性质和三维结构的影响 |
2.5 BMPR1B基因FecB突变选择作用 |
3 讨论 |
3.1 绵羊BMPR1B基因FecB突变对产羔数的遗传效应 |
3.2 绵羊BMPR1B基因FecB突变的起源及其选择作用 |
4 小结 |
第六章 绵羊ZP3基因对产羔数的遗传效应研究 |
1 材料与方法 |
1.1 试验材料 |
1.1.1 试验羊群体选择与产羔数资料记录收集 |
1.1.2 湖羊血液样本采集 |
1.1.3 本试验所用仪器设备 |
1.1.4 主要试剂 |
1.1.5 主要化学试剂的配置 |
1.1.6 本试验中所用主要分子生物学网站与软件 |
1.2 试验方法 |
1.2.1 湖羊ZP3 基因多态性检测 |
1.2.2 数据统计与性状关联分析 |
1.2.3 蛋白理化性质和三维结构预测 |
1.2.4 ZP3基因在0-180日龄阶段湖羊下丘脑、垂体和卵巢中的转录水平检测 |
1.2.5 ZP3基因选择信号检测 |
2 结果 |
2.1 湖羊ZP3基因外显子区域SNPs检测结果 |
2.2 湖羊ZP3基因多态性对产羔数遗传效应 |
2.3 rs401271989位点变异对ZP3蛋白理化性质及三维结构的影响 |
2.4 湖羊ZP3基因在下丘脑、垂体和卵巢组织中的转录水平研究 |
2.5 ZP3 基因选择信号 |
2.5.1 物种间ZP3基因选择信号 |
2.5.2 绵羊群体间ZP3基因选择信号 |
3 讨论 |
4 小结 |
第七章 全文结论 |
第八章 本研究主要创新点与下一步研究方向 |
1 本研究主要创新点 |
2 下一步研究方向 |
参考文献 |
附录 |
附表2-1 |
附表2-2 |
附表3-1 |
附表4-1 |
附表4-2 |
附表4-3 |
附表4-4 |
附表4-5 |
附表4-6 |
附表4-7 |
附表4-8 |
附表4-9 |
附表4-10 |
附图4-1 |
附图4-2 |
附图4-3 |
附图4-4 |
附图4-5 |
附图4-6 |
附图4-7 |
附图4-8 |
附图4-9 |
附图4-10 |
附图4-11 |
附图4-12 |
附图4-13 |
附图4-14 |
附表5-1 |
附图5-1 |
附表6-1 |
附图6-1 |
在读期间发表论文和申请专利 |
致谢 |
四、提高绵羊产羔率的试验(论文参考文献)
- [1]我国绵羊FecB基因的研究进展[J]. 周明亮,庞倩,陈明华,李燕,杨平贵. 草学, 2021(04)
- [2]通过调整卵泡募集改善绵羊同期发情效果的研究[D]. 陈维稷. 山东农业大学, 2021(01)
- [3]干旱地区杜泊羊与湖羊杂交后代生产性能及多胎性研究[D]. 张也. 新疆农业大学, 2021
- [4]绵羊mtDNA遗传多样性及其与胎产羔数相关性研究[D]. 肖帆. 甘肃农业大学, 2021
- [5]萨福克羊繁殖性能及GDF9基因研究[D]. 冯东青. 河北科技师范学院, 2021(08)
- [6]超长时间低温保存绵羊精液对精子遗传物质的影响[D]. 赵建清. 塔里木大学, 2021(08)
- [7]整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联[D]. 孙燕勇. 内蒙古农业大学, 2021
- [8]全基因组筛选云上黑山羊产羔数候选基因[D]. 陶林. 中国农业科学院, 2021
- [9]BMP15通过BMPR1B调控陕北白绒山羊卵泡颗粒细胞功能的分子机制[D]. 赵金. 西北农林科技大学, 2021
- [10]绵羊产羔数性状的分子遗传机理研究[D]. 种玉晴. 华中农业大学, 2021